常见的厌氧反应器有UASB厌氧反应器，IC厌氧反应器，EGSB厌氧反应器。其中UASB反应器、厌氧流化床、厌氧生物转盘和挡板式厌氧反应器属于第二代厌氧反应器，他们的主要特点有：停留时间短，有机负荷高，处理效率高；HRT和SRT分离，SRT相对很长，HRT则可以较短，反应器内生物量很高。以上这些特点改变了原来人们对厌氧生物过程的认识，因此在污水处理中应用越来越广泛。
进人20世纪90年代以后，随着以颗粒污泥为主要特点的 UASB 反应器的广泛应用，在其从础上又发展起来了同样以颗粒污泥为根本的颗粒污泥膨胀床（ EGSB ）反应器和厌氧内循环（IC）反应器。其中 EGSB 反应器利利用外加的出水循环可以使反应器内部形成很高的上升流速，提高反应器内的物质与微生物之间的接触和反应，可以在较低温度下处理较低浓度的有机污水，如城市污水等；而 IC 反应器则主要应用于处理高浓度有机污水，依靠厌氧生物过程本身所产生的大量沼气形成内部混合液的充分循环与混合，可以达到更高的有机负荷。这些反应器又被统一称为“第三代厌氧生物反应器”